Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms