Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Znf48Q3US17 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Znf48Q3US17 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms