Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ctsll3Q3ULP7 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms