Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U6N9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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