Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms