Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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