Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms