Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms