Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms