Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms