Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Sec23aQ01405 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Sec23aQ01405 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Sec23aQ01405 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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