Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top2aQ01320 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top2aQ01320 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms