Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms