Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms