Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smg6P61406 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms