Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PctpP53808 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PctpP53808 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PctpP53808 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PctpP53808 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PctpP53808 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PctpP53808 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PctpP53808 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PctpP53808 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PctpP53808 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PctpP53808 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PctpP53808 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PctpP53808 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms