Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms