Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cd28P31041 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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