Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl3P27659 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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