Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RarbP22605 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RarbP22605 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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