Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prim1P20664 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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