Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms