Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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