Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P10404 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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P10404 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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P10404 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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P10404 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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P10404 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P10404 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P10404 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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