Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RaxO35602 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RaxO35602 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RaxO35602 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RaxO35602 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RaxO35602 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RaxO35602 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RaxO35602 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RaxO35602 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RaxO35602 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RaxO35602 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RaxO35602 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RaxO35602 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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