Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm2056J3QQ02 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2056J3QQ02 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm2056J3QQ02 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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