Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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