Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34aG3UW52 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms