Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M1F7CXU4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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