Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zfp988F6VKC7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms