Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fndc1E9Q043 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc1E9Q043 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms