Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rd3lB2RV38 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms