Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 251.8 ms