Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Brpf1B2RRD7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Brpf1B2RRD7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Brpf1B2RRD7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Brpf1B2RRD7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Brpf1B2RRD7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Brpf1B2RRD7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Brpf1B2RRD7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Brpf1B2RRD7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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