Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn7aB1AYL1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Scn7aB1AYL1 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Scn7aB1AYL1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Scn7aB1AYL1 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scn7aB1AYL1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scn7aB1AYL1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn7aB1AYL1 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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