Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tubb1A2AQ07 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms