Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms