Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Rnf4Q9QZS2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf4Q9QZS2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms