Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms