Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hmgn5Q9JL35 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hmgn5Q9JL35 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms