Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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