Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Borcs8Q9D6Y4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms