Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Zcchc13Q9D548 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Zcchc13Q9D548 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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