Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc83Q9D4V3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms