Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lonrf3Q9D4H7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms