Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc47Q9D024 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc47Q9D024 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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