Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Prpf8Q99PV0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms