Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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