Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NsmfQ99NF2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms