Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PtprtQ99M80 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprtQ99M80 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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